Linka 96 neobsluhuje zastávky Prievozská, Hraničná, Nevädzová a DK Ružinov.
Do premávky sa od 8. marca 2012 opäť zaradili 15-metrové autobusy MAN 313/15 #8211 - 8215 a Mercedes-Benz Citaro L #8216 - 8217.